| Тур 1 | ||
| 14 марта 2009 года, суббота | ||
| Амкар - Ростов | 0:0 | |
| Динамо М - Москва | 1:0 | |
| Локомотив - Химки | 1:1 | |
| Рубин - Кубань | 3:0 | |
| 15 марта 2009 года, воскресенье | ||
| Сатурн - ЦСКА | 0:3 | |
| Спартак М - Зенит | 1:1 | |
| Терек - Спартак-Нальчик | 1:0 | |
| Томь - Крылья Советов | 0:1 | |
| Тур 2 | ||
| 21 марта 2009 года, суббота | ||
| Динамо М - Химки | 3:2 | |
| Крылья Советов - Амкар | 1:0 | |
| Кубань - Спартак М | 1:0 | |
| Москва - Терек | 0:0 | |
| 22 марта 2009 года, воскресенье | ||
| Зенит - Сатурн | 2:1 | |
| Ростов - Локомотив | 1:1 | |
| Спартак-Нальчик - Рубин | 0:0 | |
| 23 марта 2009 года, понедельник | ||
| ЦСКА - Томь | 0:1 | |
| Тур 3 | ||
| 03 апреля 2009 года, пятница | ||
| Химки - Ростов | 0:1 | |
| 04 апреля 2009 года, суббота | ||
| Рубин - Москва | 0:0 | |
| Сатурн - Кубань | 2:1 | |
| Терек - Динамо М | 1:0 | |
| 05 апреля 2009 года, воскресенье | ||
| Амкар - ЦСКА | 0:0 | |
| Локомотив - Крылья Советов | 2:1 | |
| Спартак М - Спартак-Нальчик | 2:0 | |
| Томь - Зенит | 0:3 | |
| Тур 4 | ||
| 10 апреля 2009 года, пятница | ||
| Крылья Советов - Химки | 3:0 | |
| 11 апреля 2009 года, суббота | ||
| Динамо М - Ростов | 1:0 | |
| Кубань - Томь | 0:0 | |
| Москва - Спартак М | 3:1 | |
| Терек - Рубин | 1:2 | |
| 12 апреля 2009 года, воскресенье | ||
| Зенит - Амкар | 0:0 | |
| Спартак-Нальчик - Сатурн | 1:1 | |
| ЦСКА - Локомотив | 4:1 | |
| Тур 5 | ||
| 18 апреля 2009 года, суббота | ||
| Ростов - Крылья Советов | 0:0 | |
| Сатурн - Москва | 0:1 | |
| Спартак М - Терек | 2:0 | |
| Томь - Спартак-Нальчик | 1:0 | |
| 19 апреля 2009 года, воскресенье | ||
| Амкар - Кубань | 1:0 | |
| Локомотив - Зенит | 1:1 | |
| Рубин - Динамо М | 3:0 | |
| Химки - ЦСКА | 0:3 | |
| Тур 6 | ||
| 25 апреля 2009 года, суббота | ||
| Динамо М - Крылья Советов | 0:1 | |
| Зенит - Химки | 4:2 | |
| Рубин - Спартак М | 0:2 | |
| Терек - Сатурн | 1:1 | |
| 26 апреля 2009 года, воскресенье | ||
| Кубань - Локомотив | 1:0 | |
| Москва - Томь | 2:1 | |
| Спартак-Нальчик - Амкар | 4:1 | |
| ЦСКА - Ростов | 1:2 | |
| Тур 7 | ||
| 02 мая 2009 года, суббота | ||
| Амкар - Москва | 0:1 | |
| Сатурн - Рубин | 0:5 | |
| Спартак М - Динамо М | 0:2 | |
| Томь - Терек | 2:1 | |
| 03 мая 2009 года, воскресенье | ||
| Крылья Советов - ЦСКА | 1:3 | |
| Локомотив - Спартак-Нальчик | 1:0 | |
| Ростов - Зенит | 2:1 | |
| Химки - Кубань | 2:2 | |
| Тур 8 | ||
| 10 мая 2009 года, воскресенье | ||
| Динамо М - ЦСКА | 1:2 | |
| Зенит - Крылья Советов | 2:0 | |
| Москва - Локомотив | 0:0 | |
| Терек - Амкар | 2:2 | |
| 11 мая 2009 года, понедельник | ||
| Кубань - Ростов | 0:0 | |
| Рубин - Томь | 4:0 | |
| Спартак М - Сатурн | 4:0 | |
| Спартак-Нальчик - Химки | 0:0 | |
| Тур 9 | ||
| 16 мая 2009 года, суббота | ||
| Амкар - Рубин | 2:2 | |
| Локомотив - Терек | 4:0 | |
| Ростов - Спартак-Нальчик | 1:1 | |
| Химки - Москва | 1:1 | |
| 17 мая 2009 года, воскресенье | ||
| Крылья Советов - Кубань | 1:0 | |
| Сатурн - Динамо М | 0:0 | |
| Томь - Спартак М | 1:1 | |
| ЦСКА - Зенит | 2:1 | |
| Тур 10 | ||
| 23 мая 2009 года, суббота | ||
| Рубин - Локомотив | 2:0 | |
| Сатурн - Томь | 0:0 | |
| Спартак М - Амкар | 5:1 | |
| 24 мая 2009 года, воскресенье | ||
| Терек - Химки | 2:0 | |
| Динамо М - Зенит | 1:0 | |
| Кубань - ЦСКА | 1:0 | |
| Москва - Ростов | 2:0 | |
| Спартак-Нальчик - Крылья Советов | 0:1 | |
| Тур 11 | ||
| 29 мая 2009 года, пятница | ||
| Амкар - Сатурн | 0:2 | |
| 30 мая 2009 года, суббота | ||
| Зенит - Кубань | 2:0 | |
| Крылья Советов - Москва | 1:1 | |
| Локомотив - Спартак М | 2:1 | |
| Ростов - Терек | 1:1 | |
| Томь - Динамо М | 2:3 | |
| 06 июля 2009 года, понедельник | ||
| Химки - Рубин | 2:3 | |
| 22 июля 2009 года, среда | ||
| ЦСКА - Спартак-Нальчик | 0:0 | |
| Тур 12 | ||
| 13 июня 2009 года, суббота | ||
| Динамо М - Кубань | 1:1 | |
| Рубин - Ростов | 0:2 | |
| Спартак М - Химки | 1:0 | |
| Терек - Крылья Советов | 3:2 | |
| 14 июня 2009 года, воскресенье | ||
| Москва - ЦСКА | 2:0 | |
| Сатурн - Локомотив | 2:0 | |
| Спартак-Нальчик - Зенит | 2:2 | |
| Томь - Амкар | 1:2 | |
| Тур 13 | ||
| 10 июля 2009 года, пятница | ||
| Химки - Сатурн | 1:0 | |
| 11 июля 2009 года, суббота | ||
| Амкар - Динамо М | 3:1 | |
| Крылья Советов - Рубин | 1:2 | |
| Ростов - Спартак М | 0:1 | |
| Терек - ЦСКА | 1:1 | |
| 12 июля 2009 года, воскресенье | ||
| Зенит - Москва | 1:0 | |
| Кубань - Спартак-Нальчик | 2:2 | |
| Локомотив - Томь | 0:0 | |
| Тур 14 | ||
| 18 июля 2009 года, суббота | ||
| Динамо М - Спартак-Нальчик | 2:1 | |
| Рубин - ЦСКА | 1:2 | |
| Сатурн - Ростов | 4:0 | |
| 19 июля 2009 года, воскресенье | ||
| Амкар - Локомотив | 1:1 | |
| Москва - Кубань | 4:1 | |
| Спартак М - Крылья Советов | 1:1 | |
| Терек - Зенит | 3:2 | |
| Томь - Химки | 4:0 | |
| Тур 15 | ||
| 24 июля 2009 года, пятница | ||
| Химки - Амкар | 2:0 | |
| 25 июля 2009 года, суббота | ||
| Зенит - Рубин | 0:0 | |
| Крылья Советов - Сатурн | 0:2 | |
| Локомотив - Динамо М | 1:1 | |
| Ростов - Томь | 0:0 | |
| 26 июля 2009 года, воскресенье | ||
| Кубань - Терек | 1:1 | |
| Спартак-Нальчик - Москва | 0:0 | |
| ЦСКА - Спартак М | 1:2 | |
| Тур 16 | ||
| 31 июля 2009 года, пятница | ||
| Рубин - Спартак-Нальчик | 2:0 | |
| 01 августа 2009 года, суббота | ||
| Спартак М - Кубань | 4:0 | |
| Терек - Москва | 1:2 | |
| Томь - ЦСКА | 2:3 | |
| 02 августа 2009 года, воскресенье | ||
| Амкар - Крылья Советов | 2:0 | |
| Локомотив - Ростов | 2:0 | |
| Сатурн - Зенит | 2:2 | |
| Химки - Динамо М | 0:2 | |
| Тур 17 | ||
| 08 августа 2009 года, суббота | ||
| Кубань - Сатурн | 0:2 | |
| Москва - Рубин | 1:3 | |
| Спартак-Нальчик - Спартак М | 2:4 | |
| 09 августа 2009 года, воскресенье | ||
| Динамо М - Терек | 0:1 | |
| Зенит - Томь | 0:2 | |
| Крылья Советов - Локомотив | 1:3 | |
| Ростов - Химки | 2:0 | |
| ЦСКА - Амкар | 1:0 | |
| Тур 18 | ||
| 16 августа 2009 года, воскресенье | ||
| Амкар - Зенит | 2:4 | |
| Локомотив - ЦСКА | 2:1 | |
| Ростов - Динамо М | 0:1 | |
| Рубин - Терек | 4:0 | |
| Сатурн - Спартак-Нальчик | 1:0 | |
| Спартак М - Москва | 2:1 | |
| Томь - Кубань | 1:0 | |
| Химки - Крылья Советов | 1:3 | |
| Тур 19 | ||
| 22 августа 2009 года, суббота | ||
| Крылья Советов - Ростов | 2:2 | |
| Москва - Сатурн | 3:1 | |
| Спартак-Нальчик - Томь | 3:0 | |
| ЦСКА - Химки | 2:1 | |
| 23 августа 2009 года, воскресенье | ||
| Динамо М - Рубин | 0:3 | |
| Зенит - Локомотив | 1:1 | |
| Кубань - Амкар | 1:0 | |
| Терек - Спартак М | 2:3 | |
| Тур 20 | ||
| 29 августа 2009 года, суббота | ||
| Локомотив - Кубань | 4:1 | |
| Сатурн - Терек | 3:0 | |
| Томь - Москва | 0:0 | |
| 30 августа 2009 года, воскресенье | ||
| Крылья Советов - Динамо М | 3:1 | |
| Ростов - ЦСКА | 1:0 | |
| Спартак М - Рубин | 0:3 | |
| Химки - Зенит | 0:4 | |
| 31 августа 2009 года, понедельник | ||
| Амкар - Спартак-Нальчик | 1:2 | |
| Тур 21 | ||
| 12 сентября 2009 года, суббота | ||
| Кубань - Химки | 2:1 | |
| Москва - Амкар | 0:2 | |
| Рубин - Сатурн | 5:1 | |
| ЦСКА - Крылья Советов | 3:0 | |
| 13 сентября 2009 года, воскресенье | ||
| Динамо М - Спартак М | 1:1 | |
| Зенит - Ростов | 2:0 | |
| Спартак-Нальчик - Локомотив | 0:1 | |
| Терек - Томь | 4:0 | |
| Тур 22 | ||
| 18 сентября 2009 года, пятница | ||
| Химки - Спартак-Нальчик | 0:2 | |
| 19 сентября 2009 года, суббота | ||
| Локомотив - Москва | 1:0 | |
| Ростов - Кубань | 3:3 | |
| Сатурн - Спартак М | 2:1 | |
| 20 сентября 2009 года, воскресенье | ||
| Амкар - Терек | 1:0 | |
| Крылья Советов - Зенит | 0:1 | |
| Томь - Рубин | 0:0 | |
| ЦСКА - Динамо М | 3:0 | |
| Тур 23 | ||
| 26 сентября 2009 года, суббота | ||
| Динамо М - Сатурн | 1:0 | |
| Зенит - ЦСКА | 2:0 | |
| Москва - Химки | 3:0 | |
| Рубин - Амкар | 1:2 | |
| 27 сентября 2009 года, воскресенье | ||
| Кубань - Крылья Советов | 0:0 | |
| Спартак М - Томь | 5:0 | |
| Спартак-Нальчик - Ростов | 1:0 | |
| Терек - Локомотив | 2:1 | |
| Тур 24 | ||
| 03 октября 2009 года, суббота | ||
| Крылья Советов - Спартак-Нальчик | 0:0 | |
| Ростов - Москва | 2:2 | |
| Томь - Сатурн | 3:1 | |
| Химки - Терек | 1:2 | |
| 04 октября 2009 года, воскресенье | ||
| Амкар - Спартак М | 1:2 | |
| Зенит - Динамо М | 2:1 | |
| Локомотив - Рубин | 2:1 | |
| ЦСКА - Кубань | 4:0 | |
| Тур 25 | ||
| 17 октября 2009 года, суббота | ||
| Динамо М - Томь | 0:1 | |
| Рубин - Химки | 2:1 | |
| Сатурн - Амкар | 2:0 | |
| Спартак-Нальчик - ЦСКА | 1:1 | |
| 18 октября 2009 года, воскресенье | ||
| Кубань - Зенит | 0:2 | |
| Москва - Крылья Советов | 2:1 | |
| Спартак М - Локомотив | 3:0 | |
| Терек - Ростов | 1:3 | |
| Тур 26 | ||
| 24 октября 2009 года, суббота | ||
| Крылья Советов - Терек | 2:0 | |
| Локомотив - Сатурн | 2:2 | |
| Химки - Спартак М | 0:3 | |
| 25 октября 2009 года, воскресенье | ||
| Амкар - Томь | 0:0 | |
| Зенит - Спартак-Нальчик | 2:2 | |
| Кубань - Динамо М | 1:1 | |
| Ростов - Рубин | 1:2 | |
| ЦСКА - Москва | 1:3 | |
| Тур 27 | ||
| 30 октября 2009 года, пятница | ||
| Сатурн - Химки | 1:0 | |
| 31 октября 2009 года, суббота | ||
| Динамо М - Амкар | 0:0 | |
| Москва - Зенит | 1:0 | |
| Рубин - Крылья Советов | 4:1 | |
| ЦСКА - Терек | 1:0 | |
| 01 ноября 2009 года, воскресенье | ||
| Спартак М - Ростов | 5:1 | |
| Спартак-Нальчик - Кубань | 4:0 | |
| Томь - Локомотив | 1:3 | |
| Тур 28 | ||
| 07 ноября 2009 года, суббота | ||
| Крылья Советов - Спартак М | 2:1 | |
| Кубань - Москва | 3:3 | |
| Ростов - Сатурн | 1:2 | |
| Химки - Томь | 1:3 | |
| 08 ноября 2009 года, воскресенье | ||
| Зенит - Терек | 2:0 | |
| Локомотив - Амкар | 1:0 | |
| Спартак-Нальчик - Динамо М | 2:4 | |
| ЦСКА - Рубин | 0:2 | |
| Тур 29 | ||
| 21 ноября 2009 года, суббота | ||
| Амкар - Химки | 2:0 | |
| Динамо М - Локомотив | 0:2 | |
| Москва - Спартак-Нальчик | 0:2 | |
| Рубин - Зенит | 0:0 | |
| Сатурн - Крылья Советов | 3:1 | |
| Спартак М - ЦСКА | 2:3 | |
| Терек - Кубань | 0:1 | |
| Томь - Ростов | 2:1 | |
| Тур 30 | ||
| 29 ноября 2009 года, воскресенье | ||
| Зенит - Спартак М | 2:1 | |
| Крылья Советов - Томь | 1:3 | |
| Кубань - Рубин | 0:3 | |
| Москва - Динамо М | 1:2 | |
| Ростов - Амкар | 1:1 | |
| Спартак-Нальчик - Терек | 4:2 | |
| Химки - Локомотив | 1:3 | |
| ЦСКА - Сатурн | 3:0 | |
